1.分離模式
毛細(xì)管電泳根據(jù)分離模式不同可以歸結(jié)出多種不同類型的毛細(xì)管電泳，見表1。毛細(xì)管電泳的多種分離模式，給樣品分離提供了不同的選擇機(jī)會，這對復(fù)雜樣品的分離分析是非常重要的。
2.操作方式
毛細(xì)管電泳可以按操作方式重新分為手動、半自動及全自動型毛細(xì)管電泳。
3.分離通道形狀
按分離通道形狀分為圓形、扁形、方形毛細(xì)管電泳等。
4.緩沖液的介質(zhì)
根據(jù)配制緩沖液的介質(zhì)的不同，可以把CE分為水相毛細(xì)管電泳和非水毛細(xì)管電泳(NACE)。NACE是以有機(jī)溶劑作介質(zhì)的電泳緩沖液代替以水為介質(zhì)的緩沖溶液，增加了疏水性物質(zhì)的溶解度，特別適用于在水溶液中難溶而不能用CE分離的物質(zhì)或在水溶液中性質(zhì)相似難以分離的同系物，拓寬了CE的分析領(lǐng)域。
下面就是毛細(xì)管電泳的主要特點
毛細(xì)管電泳通常使用內(nèi)徑為25-100μm的彈性(聚酰亞胺)涂層熔融石英管。標(biāo)準(zhǔn)毛細(xì)管的外徑為375μm，有些管的外徑為160μm。毛細(xì)管的特點是：容積小(一根100cm×75μm管子的容積僅4.4μL);側(cè)面/截面積比大，因而散熱快、可承受高電場(100-1000V/cm);可使用自由溶液、凝膠等為支持介質(zhì);在溶液介質(zhì)下能產(chǎn)生平面形狀的電滲流。
由此，可使毛細(xì)管電泳具備如下優(yōu)點：
(1)高效塔板數(shù)目在105-106片/m間，當(dāng)采用CGE時，塔板數(shù)目可達(dá)107片/m以上;
(2)快速一般在十幾分鐘內(nèi)完成分離;
(3)微量進(jìn)樣所需的樣品體積為nL級;
(4)多模式可根據(jù)需要選用不同的分離模式且僅需一臺儀器;
(5)經(jīng)濟(jì)實驗消耗不過幾毫升緩沖溶液，維持費用很低;
(6)自動CE是目前自動化程度較高的分離方法。
